Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbm38Q62176 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms