Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phox2aQ62066 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phox2aQ62066 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phox2aQ62066 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phox2aQ62066 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phox2aQ62066 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phox2aQ62066 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms