Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna11Q61716 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna11Q61716 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms