Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gli3Q61602 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gli3Q61602 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms