Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ecm1Q61508 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm1Q61508 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ecm1Q61508 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms