Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccna1Q61456 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccna1Q61456 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms