Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BcanQ61361 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BcanQ61361 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BcanQ61361 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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