Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2bQ61313 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms