Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1eQ61290 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1eQ61290 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1eQ61290 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1eQ61290 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1eQ61290 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms