Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsg101Q61187 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsg101Q61187 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms