Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CpQ61147 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CpQ61147 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CpQ61147 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CpQ61147 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CpQ61147 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CpQ61147 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CpQ61147 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CpQ61147 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CpQ61147 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CpQ61147 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CpQ61147 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CpQ61147 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CpQ61147 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CpQ61147 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CpQ61147 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CpQ61147 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CpQ61147 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CpQ61147 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CpQ61147 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CpQ61147 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CpQ61147 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CpQ61147 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CpQ61147 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CpQ61147 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CpQ61147 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CpQ61147 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CpQ61147 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CpQ61147 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CpQ61147 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CpQ61147 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CpQ61147 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CpQ61147 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CpQ61147 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CpQ61147 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CpQ61147 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CpQ61147 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CpQ61147 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CpQ61147 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CpQ61147 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CpQ61147 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CpQ61147 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CpQ61147 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CpQ61147 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CpQ61147 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CpQ61147 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CpQ61147 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CpQ61147 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CpQ61147 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CpQ61147 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CpQ61147 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CpQ61147 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CpQ61147 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CpQ61147 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CpQ61147 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CpQ61147 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CpQ61147 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CpQ61147 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CpQ61147 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CpQ61147 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CpQ61147 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CpQ61147 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CpQ61147 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CpQ61147 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CpQ61147 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CpQ61147 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CpQ61147 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CpQ61147 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CpQ61147 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CpQ61147 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CpQ61147 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CpQ61147 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CpQ61147 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CpQ61147 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CpQ61147 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CpQ61147 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CpQ61147 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms