Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf1Q61069 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf1Q61069 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf1Q61069 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf1Q61069 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf1Q61069 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf1Q61069 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf1Q61069 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf1Q61069 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usf1Q61069 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usf1Q61069 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usf1Q61069 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usf1Q61069 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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