Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms