Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SkiQ60698 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SkiQ60698 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SkiQ60698 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SkiQ60698 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SkiQ60698 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SkiQ60698 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SkiQ60698 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SkiQ60698 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms