Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Sin3aQ60520 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sin3aQ60520 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms