Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc5a6Q5U4D8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms