Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan4Q5SZT6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan4Q5SZT6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms