Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1Q5SXY1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms