Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX39

Myh4, Myosin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh4Q5SX39 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh4Q5SX39 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh4Q5SX39 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh4Q5SX39 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms