Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms