Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PfasQ5SUR0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PfasQ5SUR0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfasQ5SUR0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfasQ5SUR0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PfasQ5SUR0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms