Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd40Q5SUE8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms