Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam71bQ5STT6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam71bQ5STT6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms