Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam46cQ5SSF7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam46cQ5SSF7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam46cQ5SSF7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms