Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf12Q5SPL2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf12Q5SPL2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms