Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bhlha9Q5RJB0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlha9Q5RJB0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms