Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r209Q5NC97 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms