Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AY761185Q5ERI8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AY761185Q5ERI8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms