Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc2Q56A06 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms