Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Srrm1Q52KI8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms