Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opa3Q505D7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opa3Q505D7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms