Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3aQ4TU90 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3aQ4TU90 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3aQ4TU90 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms