Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shank3Q4ACU6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shank3Q4ACU6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms