Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxn3Q499D0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms