Protein–RNA interactions for Protein: Q497P9

Gm5941, MCG112829, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5941Q497P9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5941Q497P9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5941Q497P9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5941Q497P9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5941Q497P9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5941Q497P9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms