Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.3 ms