Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt35Q497I4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms