Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms