Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc160Q3UYG1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc160Q3UYG1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms