Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5aQ3UXZ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5aQ3UXZ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5aQ3UXZ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms