Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330034G19RikQ3UWX6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms