Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pate2Q3UW31 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pate2Q3UW31 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms