Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prom2Q3UUY6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom2Q3UUY6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms