Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Eb2Q3UUV9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb2Q3UUV9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms