Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thsd4Q3UTY6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thsd4Q3UTY6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thsd4Q3UTY6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms