Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim15Q3UTD9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim15Q3UTD9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms