Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhdc9Q3USL1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhdc9Q3USL1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms