Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B3gnt6Q3USF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms