Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28047Q3US59 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms