Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acsf3Q3URE1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acsf3Q3URE1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms